Центр колективного користування науковими приладами (ЦККНП) „Центр флуоресцентної мікроскопії”

---

Головними завданнями Центру є:

• надання вченим НАН України можливості проведення досліджень на сучасному флуоресцентному моторизованому мікроскопі Axio Imager М1;
• надання консультативних послуг щодо проведення досліджень на обладнанні Центру;
• технічне забезпечення роботи Центру.

Технічні характеристики приладу:

• Тип мікроскопу – сучасний тип світлооптичного дослідницького моторизованого мікроскопа з виправленою на нескінченність оптичною схемою (IC2S – Система з фокусом на „нескінченність”, підвищеною контрастністю та корекцією кольору), з цифровою камерою для мікроскопу, комп’ютером та програмним забезпеченням.
• Мікроскоп забезпечує дослідження в світлі, що проходить за методами світлого поля, темного поля та диференційно-інтерференційного контрасту (ДІК) та у відбитому світлі люмінесценції.
• Мікроскоп забезпечує виявлення навіть слабкого люмінесцентного свічення при збудженні в наступних областях спектру: 365 нм, 550-580 нм, 379-401 нм, 450-490 нм, 426-446 нм, 490-510 нм и 540-552 нм.
• Мікроскоп укомплектований наборами фільтрів: 20 Rhodamin, 49 DAPI, 34 Blue GFP, 38 Endow, 47 CFP, 46 YFP.
• Вузол кріплення ртутної лампи забезпечує зручну заміну лампи та її регулювання.
• Блок живлення ртутної лампи обладнаний рахівником часу роботи ртутної лампи.
• Мікроскоп укомплектований системою регулювання яскравості ртутного освітлювача.
• Предметний стіл має можливість обертання на 240 град.
• Моторизована система мікроскопа забезпечує такі функції, як установка об'єктивів, автофокусування; можливість керування через комп'ютер або через рідкокристалічний дисплей.
• Револьверний пристрій забезпечує кріплення 6 об'єктивів та є моторизованим, при цьому гніздо для кріплення об'єктивів має метричне різьблення М27 ГОСТ 3469-83 "Різьба для об'єктивів мікроскопів".
• Револьверний пристрій забезпечує чітку фіксацію об'єктивів в робочому положенні, а також обертання об'єктивів як за, так і проти годинникової стрілки без поломки механізму.
• Освітлювальна система забезпечує принцип Келлера малогабаритними та середніми за потужністю джерелами світла – галогенова лампа 100 Вт для прохідного світла та ртутна лампа 100 Вт – для люмінесцентного світла.
• Освітлювальна система забезпечує рівномірне освітлення площини предмету при роботі з об'єктивами від 1,25х до 100х.
• Об'єктиви мають наступні збільшення 10х, 20x, 40х і 100х (масляна імерсія).
• Об'єктиви мають підвищену роздільну здатність за рахунок числової апертури, збільшеної в порівнянні зі звичайною, а саме, для об’єктиву для 10х – 0,30, для 20х – 0,5, для 40х – 0,75, для 100х – 1,3.
• Освітлювальна система для світла, що проходить, є ахроматизованою з апохромним колектором (типу IC2S – оптики Цейсс).
• Тип оптичної корекції об'єктивів – напівапохроматичний для отримання вільного від хроматичного забарвлення фону.
• Блок живлення лампи вбудований і стабілізований до перепадів напруги.
• Вузол кріплення галогенової лампи забезпечує зручну заміну лампи та самоцентрування відносно оптичної системи.
• Бінокулярна насадка і механізм розсунення по очній базі, фокусуючий механізм, механізми переміщення предметного столика і конденсора виконані з металевих сплавів (не з металевої пластмаси!) і забезпечують надійну та довгострокову роботу мікроскопа.
• Предметний стіл з керамічним покриттям, стійким до чищення та реактивів.
• Оптика мікроскопу розрахована на „нескінченність” (маркування “?“ на корпусі об'єктивів) і є вільною від хроматичної різниці збільшення (ХРУ= 0%) при цьому окуляр без компенсаційної дії (відсутність в маркуванні букви «К»).
• Окуляр має лінійне поле 23 мм при збільшенні 10х з можливістю роботи в окулярах і має діоптрійне наведення на різкість для вирівнювання зображення в бінокулярній насадці.
• Конденсор – моторизований універсальний з ахроматичною та апланатичною корекцією з числовою апертурою 0,9.
• На ручці фокусуючого механізму розташовано 10 кнопок керування для настроювальних операцій, у т.ч. установки об'єктивів, настройки освітлення т.д.
• Мікроскоп забезпечує наступні підключення до зовнішніх комунікаційних пристроїв: TCP-IP, USB, CAN, RS-232.
• Конструкція мікроскопа забезпечує можливість введення будь-яких елементів, в т.ч. монохроматорів, камер, в паралельний пучок світла (між об'єктивом і візуальною частиною мікроскопа).
• Мікроскоп має сенсорний елемент для контролю Z - положення с точністю +/- 1 нм.
• Конструкція мікроскопа забезпечує захисне блокування (введення в хід освітлювальних променів засувок) при заміні елементів (наприклад, зняття кришки з револьверного пристрою, зміни світлоподільних модулів, встановлення об'єктивів в хід променів і т.д.).
• Мікроскоп має пристрій контролю яскравості джерела світла („менеджер світла”) з автоматичною установкою колірної температури 3200°К.
• Висота об'єктивів – 45 мм.
• Мікроскоп має фото/відео вихід для підключення системи документування з двома варіантами розділення світлового потоку.
• У комплект мікроскопа входить адаптер зі збільшенням 0.63x.
• Моторизований мікроскоп має можливість управління з комп'ютера (привід об'єктивів, фільтрів, положення фокусу).
• Якість зображення мікроскопа і освітлювальної системи відповідають вимогам базової моделі системи аналізу зображення.
• Мікроскоп укомплектований сенсорним TFT-монітором, за допомогою якого можна як проглядати всю інформацію про мікроскоп, так і управляти всіма моторизованими компонентами.

Основні технічні характеристики системи аналізу зображень:

• Система аналізу зображення містить монохромну цифрову камеру високого розділення.
• Камера є монохромною з розділенням 1388х1040 пікселів.
• Час інтеграції або накопичення змінюється від 1 мілісекунди до 20 сек.
• Швидкість передачі: не менше 15 кадрів у секунду (694 х 520).
• Камера має можливість застосування, як в дослідницькій діяльності, так і в повсякденній роботі.
• Управління всіма параметрами камери здійснюється через комп'ютер, без яких-небудь додаткових панелей управління або блоків живлення.
• Спосіб кріплення камери до мікроскопа – через C-mount адаптер.
• Можливість використання камери на будь-якому мікроскопі фірми Carl Zeiss (через відповідний адаптер).

Програмного забезпечення системи та її можливості:

• Камера підтримується і працює з усіма спеціальними програмами, призначеними для управління камерою та мікроскопом.
• У комплекті з камерою додається програмне забезпечення (ПЗ), що дозволяє проводити зйомку, аналіз зображень і забезпечувати управління всіма моторизованими компонентами мікроскопа.
• ПЗ надає можливість збереження зображення у всіх найпоширеніших форматах: *.bmp, *.jpg, *.tif, *.tga, *.png, *.psd, *.img, *.cmp, *.zvi.
• Створення звітів; збереження самого зображення, а також параметрів мікроскопа і камери, за яких проводилася зйомка.
• Нанесення на зображення анотацій у вигляді тексту, ліній, стрілок, прямокутників, кіл, масштабної лінійки і т.д..
• Проведення ручних вимірювань (відстань, периметр, площа, радіус кола, рівні сірого, кольорові складові, кути і т.д.).
• ПЗ містить набір функцій для поліпшення зображень, таких як зміна контрасту, згладжування, різкості, видалення шумів.
• ПЗ має вбудований Майстер (провідник) автоматичних вимірювань, що дозволяє створювати власні програми вимірювань.
• Проведення сегментації ч/б і кольорових зображень по гістограмі.
• ПЗ дозволяє аналізувати послідовності зображень або проводити автоматичне захоплення зображення з камери з подальшим аналізом.
• ПЗ дозволяє отримувати зображення різних люмінесцентних барвників в незалежних каналах з фіксацією 8 каналів, кожний канал повинен мати можливість індивідуального настроювання.
• ПЗ – ліцензоване. ПЗ працює зі всіма найбільше розповсюдженими операційними системами, починаючи від Windows 95 та закінчуючи Windows XP Pro.

Технічні характеристики комп’ютера

• Мікропроцесор Pentium IV 2.8 GHz.
• Відеокарта 128 MB.
• Жорсткий диск 10 GB.
• Оперативна пам'ять 1 GB.
• Монітор кольоровий 21”.
• CD-RW/DVD-ROM дисковід.
• Програма керування роботою флуоресцентного мікроскопа Axio Vision, Версія 4.6.3..

Головні напрямки досліджень

• Дослідження структурно-функціональних особливостей організації клітин.
• Визначення вмісту ДНК та ферментів.
• Визначення градієнту іонів кальцію.

ЗАТВЕРДЖУЮ

Директор Інституту екології Карпат НАН України

д.б.н. М.П. Козловський

ПОЛОЖЕННЯ

про Центр колективного користування науковим приладом Інституту екології Карпат НАН України

1. Створення Центру

• Центр колективного користування науковим приладом флуоресцентним моторизованим мікроскопом Axio Imager M1 (далі – Центр) створюється на базі Інституту екології Карпат НАН України для раціональнішого використання науковими установами та організаціями НАН України унікального та коштовного наукового приладу імпортного виробництва, який призначений для наукових досліджень у галузі біології та медицини, зокрема, дослідження структурно-функціональних особливостей організації клітин (вмісту ДНК та РНК, ферментів, визначення градієнту іонів кальцію).
• Інститут екології Карпат НАН України зобов'язується забезпечити якісну та надійну роботу придбаного наукового обладнання, його необхідне фахове обслуговування, створити умови найкращого використання робочого часу в інтересах наукових працівників НАН України, відсутність штучних обмежень у наданні послуг іншим науковим установам і організаціям НАН України.
• Це положення розроблено відповідно до „Типового положення про Центр колективного користування науковими приладами з наукового напряму НАН України”, затвердженого 28.04.2004 р. розпорядженням №322 Президії Національної академії наук України.

2. Структура, головні завдання і організація роботи Центру

• Центр колективного користування приладом – флуоресцентним моторизованим мікроскопом Axio Imager M1 є надбанням Національної академії наук України. Флуоресцентний мікроскоп перебуває на балансі Інституту екології Карпат НАН України.
• Центр входить до складу Інституту екології Карпат НАН України як науковий підрозділ, підпорядкований дирекції Інституту, без статусу юридичної особи. Центр колективного користування приладом має власну назву „Центр флуоресцентної мікроскопії”, яка разом з положенням про Центр затверджується Комісією з питань модернізації парку наукових приладів та обладнання НАН України (далі – Комісія).
• Головним завданням центру є надання науковцям НАН України можливості проводити дослідження на сучасному флуоресцентному мікроскопі, який обслуговується кваліфікованим персоналом, здатним підтримувати обладнання у належному робочому стані та надавати консультативні послуги.
• Наказом директора Інституту екології Карпат НАН України керівником „Центру флуоресцентної мікроскопії” призначена завідувач відділу екоморфогенезу рослин Інституту, к.б.н. О.В. Лобачевська. Загальне керівництво роботою Центру покладається на к.б.н. О.В. Лобачевську. Керівник Центру забезпечує необхідний персонал для обслуговування обладнання зі співробітників відділу екоморфогенезу рослин.
• Інститут екології Карпат НАН України, в якому створено Центр, не менше одного разу на рік звітує про роботу Центру перед Бюро Відділення загальної біології НАН України, а також, у разі необхідності, перед Комісією з питань модернізації парку наукових приладів та обладнання НАН України. В загальному річному звіті результати про роботу Центру подаються Інститутом окремим розділом в паперовому та електронному вигляді до Президії НАН України, Бюро Відділення загальної біології НАН України та до Комісії з питань модернізації парку наукових приладів та обладнання НАН України.
• Бюро Відділення загальної біології НАН України в порядку контролю розглядає на своїх засіданнях питання роботи „Центру флуоресцентної мікроскопії”. У випадку незадовільної роботи Центру відділення може у встановленому цим положенням порядку порушити питання про зміну базової наукової установи і передачу їй обладнання або закриття Центру.

3. Порядок надання послуг

• Інформація про „Центр флуоресцентної мікроскопії” (тип/марка наукового приладу, його основні характеристики та головні напрями досліджень, які можна здійснити на флуоресцентному моторизованому мікроскопі Axio Imager M1) має міститися на веб-сторінці Інституту екології Карпат НАН України. Така сама інформація про Центр розміщується на веб-сторінці Президії НАН України.
• Наукові установи та організації НАН України, які мають потребу в проведенні досліджень на науковому обладнанні Центру (далі – Замовники), два рази на рік до 15 січня і до 15 червня подають у письмовому вигляді до Бюро Відділення загальної біології НАН України свої заявки на кількість годин, строки та види досліджень, проведення яких потребує використання наукових приладів і обладнання Центру.
• Бюро Відділення загальної біології НАН України за поданням директора Інституту екології Карпат НАН України затверджує загальний розподіл між Замовниками робочого часу, відведеного для колективного користування науковим обладнанням Центру.
• Директор Інституту екології Карпат НАН України своїм наказом, узгодженим з Бюро Відділення загальної біології НАН України, визначає графік роботи Центру, встановлює необхідну кількість робочих змін на робочий день з урахуванням режиму роботи наукової установи і потреб вчених НАН України у використанні наукового обладнання Центру.
• При плануванні часу роботи Центру слід виходити з такого розподілу: для роботи в одну зміну (8 годин робочого часу) 3 години надається для потреб Інституту екології Карпат НАН України, 3 години надається безкоштовно для Замовників – інших наукових установ та організацій НАН України, 2 години дозволяється надавати для платного використання обладнання Центру іншим установам, підприємствам та організаціям, які не перебувають у віданні НАН України, згідно з чинним законодавством. Використання часу роботи наукового обладнання реєструється в робочих журналах.
• При плануванні використання часу роботи наукового приладу директор Інституту екології Карпат НАН України може застосовувати інші співвідношення використання робочого часу для власних потреб та платних послуг, однак час безкоштовного колективного користування обладнанням Центру залишається незмінним, тобто 3 години при 8-годинному робочому дні і 4 години при 12-годинному робочому дні.
• Платні послуги з використання наукового обладнання Центру для потреб інших замовників надаються на договірних засадах згідно з чинним законодавством України.
• Інститут екології Карпат НАН України бере на себе усі витрати, пов’язані із забезпеченням роботи обладнання Центру.

4. Зміна базової наукової установи, закриття Центру

• У разі недотримання вимог даного Положення, неналежної організації роботи Центру з боку Інституту екології Карпат НАН України із забезпечення колективного користування обладнанням Центру для потреб науковців НАН України або виникнення інших форс-мажорних обставин Бюро Відділення загальної біології НАН України подає Комісії з питань модернізації парку наукових приладів та обладнання НАН України пропозиції щодо передачі закріпленого за Центром обладнання іншій науковій установі НАН України з відповідною зміною назви Центру і місця його розташування.
• Комісія розглядає пропозиції Відділення загальної біології НАН України згідно з розділами 1 і 2 даного Положення, приймає рішення про зміну базової наукової установи або закриття Центру колективного користування приладом НАН України і подає його на затвердження Президії НАН України.