Почесний директор Інституту
ГОЛУБЕЦЬ Михайло Андрійович
академік НАН України, доктор біологічних наук, професор, Заслужений діяч науки і техніки України, Лауреат державної премії в галузі науки і техніки України, видатний учений у галузях ботаніки, екології, лісознавства й охорони природи, був першим директором Інституту, керував ним до 2007 року.
 
Директор Інституту
КОЗЛОВСЬКИЙ Микола Павлович
доктор біологічних наук, старший науковий співробітник,
автор понад 120 наукових праць у галузі екології, екосистемології, охорони біорізноманіття, ґрунтової зоології.

 
Заступник директора з наукової роботи
  КАНАРСЬКИЙ Юрій Васильович
кандидат біологічних наук

 
Учений секретар
  БІЛОНОГА Володимир Михайлович
кандидат біологічних наук, старший науковий співробітник.