Інститут був організатором та спів організатором конференцій:
  • III міжнародної наукової конференції «Рослинний світ у Червоній книзі України: впровадження глобальної стратегії збереження рослин» (Львів, 4-7 червня 2014 р.);
  • Міжнародної наукової конференції, присвяченої 25-річчню створення національного природного парку «Синевир»: «Біологічне різноманіття природно-заповідних об’єктів Карпат» (Ужгород, 2014);
  • Першої міжнародної науково-практичної конференції, присвяченої сторіччю ботанічних досліджень у регіоні «Наукові засади природоохоронного менеджменту екосистем Каньйонового Придністров’я» (11-12 вересня, 2014 р., м. Заліщики);
  • I (XII) Міжнародної наукової конференції молодих учених «Наукові основи збереження біотичної різноманітності» (Львів, 21-22 травня 2015 року);
  • II Міжнародної наукової конференції “Природоохоронні території в минулому, сучасному й майбутньому світі” до 130-річчя створення “Пам’ятки Пеняцької” – першої природоохоронної території у Європі (Львів – Броди – Пеняки, 26-27 жовтня 2016);
  • ІІ (ХІІІ) Міжнародної наукової конференції молодих учених «Наукові основи збереження біотичної різноманітності» (Львів, 11-13 жовтня 2017 року);
  • «Стан і біорізноманіття екосистем Шацького національного природного парку та інших природоохоронних територій» (7-10 вересня 2017 р., смт. Шацьк);
  • II міжнародної науково-практичної конференції «Наукові засади природоохоронного менеджменту екосистем Каньйонового Придністров’я», присвяченої 170-й річниці публікації праці Рудольфа Кнера, яка стала початком грунтовних палеонтологічних досліджень Дністровського каньйону (14-15 вересня, 2017 року, м. Заліщики);
  • XIV з’їзду Українського ботанічного товариства (Київ, 25-26 квітня 2017 року).